Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PEX6Q13608 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms