Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NAE1Q13564 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.2 ms