Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NEUROD1Q13562 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms