Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TUBB3Q13509 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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TUBB3Q13509 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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