Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SF3B2Q13435 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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