Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms