Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SP140Q13342 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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SP140Q13342 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SP140Q13342 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SP140Q13342 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SP140Q13342 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SP140Q13342 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SP140Q13342 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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SP140Q13342 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
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SP140Q13342 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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