Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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SKP2Q13309 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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SKP2Q13309 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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SKP2Q13309 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
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SKP2Q13309 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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SKP2Q13309 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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