Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRIM28Q13263 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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