Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168 ms