Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHAF1AQ13111 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHAF1AQ13111 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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