Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRHP20396 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRHP20396 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRHP20396 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
TRHP20396 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
TRHP20396 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms