Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CRXO43186 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CRXO43186 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CRXO43186 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CRXO43186 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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