Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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