Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRERF1Q96PN7 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRERF1Q96PN7 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms