Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
BCANQ96GW7 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCANQ96GW7 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
BCANQ96GW7 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCANQ96GW7 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCANQ96GW7 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCANQ96GW7 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
BCANQ96GW7 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms