Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED9Q6R2W3 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZBED9Q6R2W3 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ZBED9Q6R2W3 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms