Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CNGA3Q16281 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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