Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
HERC1Q15751 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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