Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERC3Q15034 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.8 ms