Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CDK13Q14004 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CDK13Q14004 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
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