Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBFBQ13951 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms