Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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PKP1Q13835 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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PKP1Q13835 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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