Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SPTAN1Q13813 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SPTAN1Q13813 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms