Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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SHROOM2Q13796 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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SHROOM2Q13796 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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SHROOM2Q13796 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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SHROOM2Q13796 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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SHROOM2Q13796 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
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SHROOM2Q13796 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
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SHROOM2Q13796 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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SHROOM2Q13796 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
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SHROOM2Q13796 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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SHROOM2Q13796 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SHROOM2Q13796 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
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