Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NEUROD1Q13562 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms