Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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TCOF1Q13428 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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TCOF1Q13428 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TCOF1Q13428 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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TCOF1Q13428 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
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TCOF1Q13428 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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TCOF1Q13428 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
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TCOF1Q13428 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
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