Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
XRCC4Q13426 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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