Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDE3BQ13370 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms