Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SRSF6Q13247 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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