Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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CBX3Q13185 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CBX3Q13185 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CBX3Q13185 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CBX3Q13185 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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CBX3Q13185 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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