Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RPA4Q13156 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
RPA4Q13156 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPA4Q13156 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms