Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CALCOCO2Q13137 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CALCOCO2Q13137 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CALCOCO2Q13137 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CALCOCO2Q13137 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CALCOCO2Q13137 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CALCOCO2Q13137 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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