Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CHAF1BQ13112 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms