Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms