Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MKRN3Q13064 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms