Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
PRDM2Q13029 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PRDM2Q13029 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms