Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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