Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms