Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPS29P62273 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPS29P62273 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RPS29P62273 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RPS29P62273 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RPS29P62273 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RPS29P62273 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPS29P62273 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPS29P62273 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPS29P62273 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPS29P62273 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RPS29P62273 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.6 ms