Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
CENPFP49454 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPFP49454 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPFP49454 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CENPFP49454 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CENPFP49454 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CENPFP49454 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPFP49454 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPFP49454 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPFP49454 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.38
CENPFP49454 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CENPFP49454 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPFP49454 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPFP49454 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPFP49454 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPFP49454 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPFP49454 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPFP49454 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPFP49454 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPFP49454 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPFP49454 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CENPFP49454 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
CENPFP49454 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms