Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VPREB1P12018 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
VPREB1P12018 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
VPREB1P12018 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
VPREB1P12018 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms