Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BRPF3Q9ULD4 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms