Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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COPS7AQ9UBW8 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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COPS7AQ9UBW8 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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COPS7AQ9UBW8 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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COPS7AQ9UBW8 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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