Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms