Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMG1Q96Q15 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.28□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
SMG1Q96Q15 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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