Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SNX29Q8TEQ0 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms