Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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RTL8BQ17RB0 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RTL8BQ17RB0 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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