Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
IMPG1Q17R60 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IMPG1Q17R60 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms