Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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FAM187BQ17R55 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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FAM187BQ17R55 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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FAM187BQ17R55 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FAM187BQ17R55 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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